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Ja, bei mir funktioniert es so - die zweite Farbton/Sättigung-Ebene von unten wird ausgeblendet. Ich habe die for-Schleife noch mal umgeschrieben, falls Du die zweite Farbton/Sättigung-Ebene von oben ausblenden willst (und statt count = count + 1 kannst Du auch count++ schreiben):

var count = 0
for (var i = 0; i < activeDocument.artLayers.length-1; i++) {
  activeDocument.activeLayer = activeDocument.artLayers[i];
  if (activeDocument.activeLayer.kind == LayerKind.HUESATURATION) {
    count++
    if (count == 2) {
       activeDocument.activeLayer.visible = false;
    }

  }
}

activeDocument.close(SaveOptions.SAVECHANGES);