Um einzelne Pixel zu entfernen, habe ich mal ein Script geschrieben (funktioniert nicht 100%, aber besser, als das ganze von Hand zu erledigen)...
https://filehorst.de/d/dkzqqaxj
Script in folgenden Ordner kopieren: C:\Program Files\Adobe\Adobe Photoshop 2020\Presets\Scripts
Das Script steht dann unter > Datei > Scripten > pixel removement zur Verfügung (und kann mit einem Shortcut versehen oder auch in eine Aktion eingebaut werden).