Nimm beim Speichern einfach das .psd - Format, dann klappts auch mit den Ebenen.
Wegen Programm:
Wenn du ein paar Euro in die Hand nehmen möchtest, ist Affinity Photo eine sehr gute Alternative, die dem alten CS2 überlegen sein dürfte. CS2 ist mittlerweile 12 Jahre alt, sodass du mit aktuellen Alternativen ebenso gut/besser bedient sein dürftest.
Kostenlos gibt es GIMP, das aber unter anderem die Einstellungsebenen vermissen lässt.