Zu einem ist die Frage in wieweit Windows Photo / Faststone Image Viewer Farbprofile unterstützen.
Hier mal ein Bild mit dem du das Testen kannst findest du hier:
http://www.k-h-photo.de/farbprofile_im_browser.html
Lade dir das Bild runter und öffne es dann in deinen Programmen, wenn sie Farbprofile unterstützen wird das Wort "Rot" in roter Farbe gezeigt das Wort "Blau" in Blauer usw, unterstützen sie es nicht weich Wort und Farbe von einander ab.
Unterstütz eins der Programe keine Profile könnte das schon mal eine Ursache sein.
Die 2te Frage ist ob Windows Photo / Faststone Image Viewer überhaupt die CR2 Datei öffnen, den soweit ich weis beten einige Cameras in ihren RAW Dateien direkt eine .jpg mit Datei mit ein. Es kann also sein das die Programe nicht die CR2 öffnen sondern nur die jpg die da auch drin ist.
Da muss dir aber einer helfen der mehr Ahnung davon hat als ich.
3te Frage ist wie öffnest du Camera Raw, ich weis das man in Lightroom Voreinstellungen machen kan mit denn dann alle RAW Dateien geöffnet werden. Was bedeutet das die Dateien automatich beim öffnen schon bearbeitet werden.
Ob das auch so ist wenn du sie über die Bidge öffnest oder im Camera Raw Fillter in PS weis ich nicht, auch da muss dir jemand anders weiter helfen.
Du siehst aber das es viele Ursachen haben kann und vielleicht hilft dir das schon weiter.
Gut wären auch ein paar Screenshots von den Geöffneten Bildern Einmal in CR geöffnet und einmal in den andern Programen so das wir uns mal ein Bild davon machen können wo die Unterschiede genau liegen.