Hallo!
Du öffnest die Datei in PS und legst darunter zwei neue Ebenen an:
Eine komplett leere Ebene und darunter eine farbige Ebene, z.B. rot.
Nun machst du einen Rechtsklick auf die Ebenenminiatur der Icon-Ebene und wählst "Fülloptionen". Den rechten Regler von "Diese Ebene" schiebst du soweit nach links, bis alles Weiß verschwunden ist, und bestätigst mit OK. Diese Ebene reduzierst du mit der darunterliegenden leeren Ebene auf eine Ebene und löschst auch die farbige Ebene.
Nun hast du die Icons auf transparentem Hintergrund.
Mit dem Ebeneneffekt
"Farbüberlagerung" kannst du die Icons färben.
Mit dem Freistellungs-Werkzeug
kannst du jedes Icon auf eine von dir definierte Größe ausschneiden.