Knoppix schon probiert?
Vermutlich hast du keinen Virus sondern einen Trojaner, der dir interessante Daten rübergeschickt hat - da reicht schon ein nicht sicheres Plug-In oder auch ein nicht aktuelles Windows aus, um den zu bekommen.
Ich befürchte, dass die von AntiVir gemeldeten Dateien Systemdateien waren, die du so zerschossen hast. Vielleicht hilft sogar eine Reparatur mit Hilfe der Start-CD von Windows um an die Daten zu kommen. Wenn du nicht formatieren willst, kannst du mit
Spybot Search&Destroy mal nach Malware und Trojanern Ausschau halten.
Und fürs nächste Mal: Wenn du solch eine Virenmeldung hast - sperren, notieren, recherchieren ehe du irgendetwas löschst